Beim Start initialisiert und reserviert sich xyZET den TCP-IP Port 1800. Über diesen Port ist es anschließend in der Lage, Steuerungsanweisungen von außen zu empfangen. Diese Anweisungen können auch von externen Webservern kommen, insbesondere kann xyZET seit der Version 3.0 des Programms auch Experimente direkt von solchen Servern laden.
Für den praktischen Einsatz ist dies von wesentlicher Bedeutung:
Lernmaterialien können auf diese Weise zentral und in kompakten Einheiten zusammen mit den zugehörigen Experimenten auf einem Server bereit gestellt werden, sie sind damit schnell aktualisierbar und von überall aus verfügbar.
Die externe Steuerung ist von besonderer Bedeutung, wenn sich xyZET im befindet, die "normale" Bedienoberfläche dem Benutzer also nicht zur Verfügung steht. In diesem Fall sind die möglichen Interaktionen des Lernenden mit dem Programm durch Hyperlinks im begleitenden HTML-Lernmaterial definiert, das in einem WEB-Browserfenster parallel zum Simulationsfenster von xyZET dargestellt wird.
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